Фотографировать через микроскоп можно разными способами. Многие современные модели микроскопов имеют встроенную цифровую камеру, соединяемую по USB с персональным компьютером. При этом очень легко фотографировать. Если микроскоп не оборудован встроенной камерой, возможность фотографировать все равно остается. Производятся камеры, которые можно установить вместо окуляра. Также, через специальный адаптер, можно присоединить к микроскопу компактную фотокамеру или «зеркалку». Компактные камеры монтируются так, чтобы своим объективом «смотреть» в окуляр микроскопа, а зеркальные – путем замены объектива камеры на адаптер для окулярной трубки.